# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ReactomePA”)

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ReactomePA。

Reactome途径分析

Bioconductor版本:2.13

这个包提供了路径分析功能基于REACTOME通路数据库。它将实现富集分析,基因集富集分析和功能模块检测。

作者:Guangchuang Yu < guangchuangyu gmail.com >

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

安装

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文档

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PDF	R脚本	ReactomePA - R包Reactome途径分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,生物信息学,通路,软件,可视化
版本	1.6.1
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(4年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	方法,AnnotationDbi,reactome.db,org.Hs.eg.db,剂量stats4,plyr,igraph,qvalue、图形、石墨
链接
建议	clusterProfiler,GOSemSim,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	clusterProfiler,剂量
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ReactomePA_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	ReactomePA_1.6.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ReactomePA_1.6.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/reactomepa/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ReactomePA/
包下载报告	下载数据