##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类星体”)

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见QuasR．

在R中量化和注释短读

Bioconductor版本:2.13

这个包为短读的量化和分析提供了一个框架。它涵盖了一个完整的工作流程，从原始序列读取，比对和质量控制图的创建，到感兴趣的基因组区域的量化。

作者:Anita Lerch, Dimos Gaiditzis和Michael Stadler

维护者:Michael Stadler < Michael。斯塔德勒在fmi.ch>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“类星体”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“QuasR”)

PDF	R脚本	类星体简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPseq，遗传学，HighThroughputSequencing，Methylseq，预处理，RNAseq，软件
版本	1.2.2
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.15.0)，平行，GenomicRanges(> = 1.13.3),Rbowtie
进口	方法,zlibbioc，BiocGenerics，IRanges，BiocInstaller，Biobase，Biostrings，GenomicRanges，BSgenome，Rsamtools(> = 1.13.1),GenomicFeatures，ShortRead(> = 1.19.1)
链接	Rsamtools
建议	Rsamtools，rtracklayer，Gviz，RUnit，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	QuasR_1.2.2.tar.gz
Windows二进制	QuasR_1.2.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	QuasR_1.2.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/QuasR/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/QuasR/
软件包下载报告	下载数据