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OSAT
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅OSAT。
OSAT:最优样本分配的工具
Bioconductor版本:2.13
相当大的基因组学研究,如微阵列通常包括使用多个批次实验(集团)由于实际的并发症。批处理的影响降到最低,仔细实验设计应该保证均匀分布的生物组织和各批次的混杂因素。OSAT(最优样本分配工具)是为了便于收集样品的分配到不同的批次。用最小的步骤,它产生的设置,优化样品的均匀分布在生物兴趣分组到不同的批次,减少混淆或感兴趣的批次和生物变量之间的相关性。它甚至还可以优化分配各批次的混杂因素。我们的工具可以处理具有挑战性的情况不完整和不平衡样本集合RCBD以及理想的平衡。OSAT提供了一些预定义布局的一些最常用的基因组平台。可以在http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689找到相关论文。
作者:李岩
维护人员:李岩<李。燕在roswellpark.org >
从内部引用(R,回车引用(“OSAT”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“OSAT”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“OSAT”)
| R脚本 | 介绍OSAT | |
| gSetupBlock.pdf | ||
| gSetupOptimal.pdf | ||
| Meth450_Tracking_Sheet_onepage.pdf | ||
| paired.pdf | ||
| random.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 生物信息学,DataRepresentation,设计,质量控制,软件,可视化 |
| 版本 | 1.10.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | 方法,统计数据 |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | xtable,Biobase |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689 |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | OSAT_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | OSAT_1.10.0.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | OSAT_1.10.0.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/osat/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/OSAT/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
