要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

MinimumDistance

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MinimumDistance

在病例-亲本三人组中进行新生CNV检测的软件包

Bioconductor版本:2.13

基于高维基因分型平台的三组从头拷贝数变异分析

作者:Robert B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护者:Robert B Scharpf

引文(从R内,输入引用(“MinimumDistance”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“MinimumDistance”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MinimumDistance”)

PDF R脚本 检测病例-亲本三人组中从头拷贝数的改变
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 生物信息学CopyNumberVariants微阵列单核苷酸多态性软件
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.10 (R-2.15)(4年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.14),BiocGenerics(> = 0.3.2),IRanges(> = 1.13.30)
进口 方法,DNAcopy跑龙套,二甲基砜晶格BiocGenericsVanillaICE(> = 1.21.24),ffBiobase(> = 2.17.8),foreacholigoClasses(> = 1.21.12),GenomicRangesmatrixStats
链接
建议 human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),SNPchipRUnit
SystemRequirements
增强了 doSNOW
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 MinimumDistance_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 MinimumDistance_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) MinimumDistance_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/MinimumDistance/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心