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MSstats
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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSstats。
质蛋白质意义分析SRM和DIA Label-free或基于标签的蛋白质组学实验
Bioconductor版本:2.13
一套工具对蛋白质意义分析label-free或质SRM和DIA实验。
作者:之一Meena Choi < choi67 purdue.edu >, Ching-Yun Chang < chang54 purdue.edu >,奥尔加Vitek < ovitek purdue.edu >
维护人员:之一Meena崔< choi67 purdue.edu >
从内部引用(R,回车引用(“MSstats”)):
安装
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MSstats”)
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MSstats”)
| Comparison1.pdf | ||
| Comparison2.pdf | ||
| Condition1.pdf | ||
| Condition2.pdf | ||
| DIA_constant_QQPlot4.pdf | ||
| DIA_constant_ResidualPlot4.pdf | ||
| DIA_ProfilePlot_269.pdf | ||
| DIA_ProfilePlot_377.pdf | ||
| Heatmap45Yeast1.pdf | ||
| Heatmap45Yeast2.pdf | ||
| LCMS_constant_ResidualPlot.pdf | ||
| LCMS_Heatmap.pdf | ||
| LCMS_ProfilePlot.pdf | ||
| MSstatsOverview.pdf | ||
| power.pdf | ||
| ProfilePlot1.pdf | ||
| ProfilePlot2.pdf | ||
| R脚本 | 蛋白质定量质SRM, DIA实验 | |
| QCPlot_all.pdf | ||
| QCPlot_all_before.pdf | ||
| QQPlot2.pdf | ||
| ResidualPlot2.pdf | ||
| SampleSizeReplicateYeast.pdf | ||
| SRM_QQPlot_perFeature_heavy.pdf | ||
| SRM_QQPlot_perFeature_light.pdf | ||
| Volcano45Yeast1.pdf | ||
| Volcano45Yeast2.pdf | ||
| VolcanoYeast1.pdf | ||
| VolcanoYeast2.pdf | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 软件 |
| 版本 | 2.0.1 |
| Bioconductor自 | BioC 2.13 (r - 3.0)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.0),Rcpp,MSnbase |
| 进口 | lme4,marray,limma,gplots,ggplot2 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 包的来源 | MSstats_2.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | MSstats_2.0.1.zip |
| Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | MSstats_2.0.1.tgz |
| Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
| Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/msstats/tree/release - 2.13 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MSstats/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
