安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MMDiff”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

MMDiff

这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MMDiff。

统计测试ChIP-Seq数据集

Bioconductor版本:2.13

这个包检测显著统计学差异读浓缩概要文件在不同ChIP-Seq样本。利用形状差异它使用内核方法(最大的差异,多党民主运动)。

作者:Gabriele Schweikert

维护人员:Gabriele Schweikert < G。在ed.ac.uk Schweikert >

从内部引用(R,回车引用(“MMDiff”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MMDiff”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MMDiff”)

PDF R脚本 分析ChIP-Seq数据与“MMDiff”包
PDF 参考手册

细节

biocViews ChIPseq,MultipleComparisons,软件
版本 1.2.1 "
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.14.0),GenomicRanges平行,DiffBind,GMD,Rsamtools
进口