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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MEDIPS．

(MeD)IP-seq数据分析

Bioconductor版本:2.13

MEDIPS是用于分析甲基化DNA免疫沉淀(MeDIP)实验和测序(MeDIP-seq)的数据。然而，MEDIPS为其他类型的定量测序数据(如ChIP-seq, MBD-seq, CMS-seq等)的分析提供了一些功能，包括计算样本组间的差异覆盖率以及饱和度和相关性分析。

作者:卢卡斯·查韦斯，马蒂亚斯·林哈德，约恩·迪特里希

维护者:Lukas Chavez

安装

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文档

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PDF	R脚本	MEDIPS
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq，CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialExpression，HighThroughputSequencing，预处理，质量控制，测序，软件，可视化
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.0)，BSgenome，DNAcopy
进口	Biostrings，BSgenome，Rsamtools、图形、gtools，IRanges，方法，统计，utils，GenomicRanges，刨边机，GenomicFeatures，DNAcopy，biomaRt，rtracklayer
链接
建议	BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，MEDIPSData
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	MEDIPS_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MEDIPS_1.12.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	MEDIPS_1.12.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/MEDIPS/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MEDIPS/
软件包下载报告	下载数据