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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅IsoGeneGUI。

一个图形用户界面进行剂量反应分析微阵列数据

Bioconductor版本:2.13

IsoGene图形用户界面(IsoGene-GUI)是一个用户友好的界面IsoGene包的目的是识别的基因表达水平对单调趋势增加剂量使用一些测试数据:全球似然比检验(E2), 1961年巴塞洛缪,巴洛et al . 1972和罗伯逊et al . 1988),威廉姆斯(1971、1972),马库斯(1976),M(胡锦涛等人。2005)和修改后的M(林et al . 2007年)。全球的假定值(E2)的似然比检验,得到了使用不准确的分布和排列。其他四个测试统计数据获得使用排列。几个假定值调整提供:Bonferroni,霍姆(1979),业务(1988),和Sidak程序控制family-wise I型错误率(弗兰克-威廉姆斯),和BH业务(Benjamini和1995)和(2001年Benjamini和Yekutieli)程序用于控制罗斯福。推理是基于重采样方法,控制错误发现率(罗斯福)(两排列(Ge et al ., 2003)和微阵列(SAM)的意义分析,獠牙et al ., 2001)。

作者:Setia Pramana,丹林,菲利普·哈德曼韦贝克托拜厄斯

维护人员:Setia Pramana < Setia。在ki.se pramana >

安装

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文档

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PDF	R脚本	IsoGeneGUI装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,GUI,微阵列,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	tcltk,tkrplot,IsoGene
进口	乘,relimp,WriteXLS,gdata,RColorBrewer,geneplotter
链接
建议	RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.ibiostat.be/software/IsoGeneGUI/index.html
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	IsoGeneGUI_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	IsoGeneGUI_1.18.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	IsoGeneGUI_1.18.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/isogenegui/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IsoGeneGUI/
包下载报告	下载数据