要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HiTC”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见HiTC.
Bioconductor版本:2.13
HiTC包的开发是为了探索高通量的“C”数据,如5C或Hi-C。
作者:Nicolas Servant
维护者:Nicolas Servant < Nicolas。curie.fr>的仆人
引文(从R内,输入引用(类似“HiTC”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“HiTC”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(类似“HiTC”)
R脚本 | 高通量染色体构象捕获分析 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | HighThroughputSequencing,测序,软件 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.10 (R-2.15)(4年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.15.0),方法,GenomicRanges,IRanges,矩阵,RColorBrewer |
进口 | 方法,Biobase,Biostrings,图形,grDevices,rtracklayer |
链接 | |
建议 | rtracklayer,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | HiTC_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | HiTC_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | HiTC_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/HiTC/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/HiTC/ |
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