安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Harshlight”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Harshlight。
Bioconductor版本:2.13
包是用来检测扩展、扩散和紧凑的微阵列芯片上的瑕疵。Harshlight自动标志着地区一批芯片(affybatch对象)和纠正affybatch对象返回,叛逃的区域替换与NAs或中位数的值相同的集合中的其他芯片探针。新版本处理替代值作为整个矩阵来解决内存问题。
作者:Mayte Suarez-Farinas Maurizio Pellegrino,克努特·m·Wittkowski马塞洛·o·马尼亚斯科领导
维护人员:Maurizio Pellegrino < mpellegri berkeley.edu >
从内部引用(R,回车引用(“Harshlight”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“Harshlight”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Harshlight”)
R脚本 | Harshlight | |
参考手册 |
biocViews | AffymetrixChip,微阵列,预处理,质量控制,ReportWriting,软件 |
版本 | 1.34.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.9 (r - 2.4)(9.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.10) |
进口 | affy,altcdfenvs,Biobase统计,跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://asterion.rockefeller.edu/Harshlight/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | Harshlight_1.34.0.tar.gz |
Windows二进制 | Harshlight_1.34.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | Harshlight_1.34.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/harshlight/tree/release - 2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Harshlight/ |
包下载报告 | 下载数据 |