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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GeneRegionScan．

GeneRegionScan

Bioconductor版本:2.13

一个软件包，重点分析基因组的离散区域。这个包对于使用Affymetrix数据调查一个或几个基因非常有用，因为它将使用Affymetrix Power Tools应用程序提取探针级数据，并将这些数据包装到ProbeLevelSet中。ProbeLevelSet直接扩展了expressionSet，但是包含了关于每个探测序列和它所派生的探测集的附加信息。该包包括许多函数，用于绘制这些探针级数据作为沿着mrna链序列的位置函数。这可以用于可变剪接的分析，特别适合用于外显子阵列数据。

作者:Lasse Folkersen, Diego Diez

维护者:Lasse Folkersen < Lasse。Folkersen在ki.se>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GeneRegionScan”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneRegionScan”)

PDF	R脚本	GeneRegionScan
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，微阵列，OneChannel，单核苷酸多态性，软件，可视化
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法,Biobase(> = 2.5.5),Biostrings
进口	Biobase(> = 2.5.5),affxparser，RColorBrewer，Biostrings
链接
建议	BSgenome，affy，AnnotationDbi
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	GeneRegionScan_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	GeneRegionScan_1.18.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GeneRegionScan_1.18.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/GeneRegionScan/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GeneRegionScan/
软件包下载报告	下载数据