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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSEABase。

基因集富集的数据结构和方法

Bioconductor版本:2.13

这个包提供了类和方法支持基因集富集分析(GSEA)。

作者:马丁·摩根Seth猎鹰,罗伯特先生

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“GSEABase”)

PDF	R脚本	介绍GSEABase
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,基础设施,软件
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.6.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),注释、方法、图(> = 1.37.2)
进口	AnnotationDbi,XML
链接
建议	hgu95av2.db,GO.db,org.Hs.eg.db,Rgraphviz,ReportingTools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AGDEX,BicARE,gCMAP,GSVA,GSVAdata,承诺
进口我	类别,categoryCompare,cellHTS2,gCMAPWeb,GSRI,GSVA,HTSanalyzeR,PCpheno,phenoTest,承诺,ReportingTools
建议我	BiocCaseStudies,计,GlobalAncova,globaltest,GOstats,GSEAlm,PGSEA,phenoTest
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GSEABase_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	GSEABase_1.24.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	GSEABase_1.24.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/gseabase/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSEABase/
包下载报告	下载数据