要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GGtools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GGtools.
Bioconductor版本:2.13
用于基因表达和/或DNA甲基化遗传学分析的软件和数据
作者:VJ Carey
维护者:VJ Carey
引文(从R内,输入引用(“GGtools”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GGtools”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“GGtools”)
R脚本 | GGtools: eQTL鉴定软件 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 | |
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 4.10.0 |
在Bioconductor | BioC 1.9 (R-2.4)(9.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.14), stats4,GGBase(> = 3.19.7),IRanges,GenomicRanges,Rsamtools |
进口 | 方法,utils,统计,BiocGenerics,snpStats,ff,AnnotationDbi,Biobase,位,VariantAnnotation |
链接 | |
建议 | GGdata,illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20120608 |
SystemRequirements | |
增强了 | MatrixEQTL |
URL | |
全靠我 | ceu1kg,cgdv17,cheung2010,encoDnaseI,ggtut |
进口我 | ceuhm3 |
建议我 | hmyriB36,ind1KG |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | GGtools_4.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | GGtools_4.10.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | GGtools_4.10.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/GGtools/tree/release-2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |