要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GEOquery”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

GEOquery

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见GEOquery

从NCBI基因表达Omnibus (GEO)获取数据

Bioconductor版本:2.13

NCBI基因表达综合(GEO)是微阵列数据的公共存储库。考虑到这些资源丰富多样的性质,很自然地想要将BioConductor工具应用于这些数据。GEOquery是GEO和BioConductor之间的桥梁。

作者:Sean Davis

维护者:Sean Davis

引文(从R内,输入引用(“GEOquery”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“GEOquery”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GEOquery”)

PDF R脚本 GEOquery
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport微阵列OneChannel圣人软件TwoChannel
版本 2.28.0
在Bioconductor BioC 1.8 (R-2.3)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 方法,Biobase
进口 XMLRCurl
链接
建议 limmaRUnit
SystemRequirements
增强了
URL http://watson.nci.nih.gov/~sdavis
全靠我 DrugVsDiseasedyebiasexamplesGEOmetadb扫描。通用产品
进口我 BeadArrayUseCasesChIPXpressSRAdbvirtualArray
建议我 antiProfilesDatadyebiasGeneExpressionSignature甲状旁腺parathyroidSEPGSEATargetScore
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 GEOquery_2.28.0.tar.gz
Windows二进制 GEOquery_2.28.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) GEOquery_2.28.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/GEOquery/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GEOquery/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心