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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见EDASeq．

RNA-Seq的探索性数据分析和归一化

Bioconductor版本:2.13

RNA-Seq读取数据的数值和图形摘要。用于调整gc含量对读取计数的影响(或其他基因水平效应)的巷内归一化程序:黄土稳健局部回归、全局标度和全分位数归一化(Risso等，2011)。调整车道间分布差异(例如，排序深度)的车道间归一化程序:全局尺度和全分位数归一化(布拉德等人，2010年)。

作者:Davide Risso和Sandrine Dudoit

维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>

安装

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文档

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PDF	R脚本	EDASeq: RNA-Seq数据的探索性数据分析和归一化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，HighThroughputSequencing，预处理，质量控制，RNAseq，软件
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	BiocGenerics(> = 0.1.3),Biobase(> = 2.15.1),ShortRead(> = 1.11.42),Rsamtools(> = 1.5.75),aroma.light
进口	方法、图形BiocGenerics，IRanges(> = 1.13.9),DESeq
链接
建议	yeastRNASeq，leeBamViews，刨边机，DESeq
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	HTSFilter，oneChannelGUI
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	EDASeq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	EDASeq_1.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	EDASeq_1.8.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/EDASeq/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EDASeq/
软件包下载报告	下载数据