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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DrugVsDisease。

疾病和药物的比较资料使用基因集富集分析

Bioconductor版本:2.13

这个包生成排名列表疾病或药物基因差异表达的概要文件。输入数据可以从数组表达或地理,下载或从当地移动电话文件。排名列表相关的微分表达式和使用Limma假定值的计算。浓缩的分数(萨勃拉曼尼亚et al . 2005年PNAS)计算参考设置默认的药物或疾病的资料,或一组用户提供的自定义数据。网络可视化的重要分数Cytoscape格式的输出。

作者:c . Pacini

维护人员:j。Saez-Rodriguez < saezrodriguez在ebi.ac.uk >

安装

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文档

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PDF	R脚本	DrugVsDisease
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件
版本	2.2.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.10),affy,limma,biomaRt,ArrayExpress,GEOquery,DrugVsDiseasedata,cMap2data,qvalue
进口	注释,hgu133a.db,hgu133a2.db,hgu133plus2.db,RUnit,BiocGenerics,xtable
链接
建议
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增强了
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取决于我
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建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	DrugVsDisease_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	DrugVsDisease_2.2.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DrugVsDisease_2.2.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/drugvsdisease/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DrugVsDisease/
包下载报告	下载数据