安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (DSS)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DSS。
Bioconductor版本:2.13
决策支持系统是一个基于R库执行差分析点测序数据。它从RNA-seq(度)的差异表达基因检测,和不同的甲基化位点或地区(DML / dmr)从酸性亚硫酸盐测序(BS-seq)。DSS的核心是一种新的色散收缩色散参数估算方法从Gamma-Poisson或Beta-Binomial分布。
作者:吴皓<郝。吴:emory.edu >
维修工:吴皓<郝。吴:emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(DSS)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (DSS)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (DSS)
R脚本 | 微分表达式与色散收缩RNA-seq数据 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ChIPseq,DNAMethylation,DifferentialExpression,HighThroughputSequencing,RNAseq,软件 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (r - 2.15)(3.5年) |
许可证 | GPL |
取决于 | Biobase,locfdr |
进口 | 方法,bsseq,刨边机 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | DSS_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | DSS_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | DSS_1.8.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/dss/tree/release - 2.13 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DSS/ |
包下载报告 | 下载数据 |