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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DESeq2．

基于负二项分布的差异基因表达分析

Bioconductor版本:2.13

基于使用负二项分布的模型，估计来自高通量测序测定的计数数据中的方差-均值依赖性，并检验差异表达

作者:Michael Love (MPIMG柏林)，Simon Anders, Wolfgang Huber (EMBL海德堡)

维护者:Michael Love

安装

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文档

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browseVignettes(“DESeq2”)

PDF	R脚本	使用“DESeq2”软件包分析RNA-Seq数据
PDF		vst.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPseq，DifferentialExpression，HighThroughputSequencing，RNAseq，圣人，软件
版本	1.2.10
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证	GPL (>= 3)
取决于	GenomicRanges，IRanges，Rcpp(> = 0.10.1),RcppArmadillo(> = 0.3.4.4)
进口	BiocGenerics(>= 0.7.5)，方法locfit，genefilter，RColorBrewer，晶格
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	RUnit，Biobase，parathyroidSE，pasilla(> = 0.2.10),vsn，gplots，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我	HTSFilter，ReportingTools
建议我	BiocGenerics，DiffBind，计
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	DESeq2_1.2.10.tar.gz
Windows二进制	DESeq2_1.2.10.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	DESeq2_1.2.10.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/DESeq2/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DESeq2/
软件包下载报告	下载数据