要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChIPXpress”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ChIPXpress

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ChIPXpress

ChIPXpress:利用公开的基因表达谱,从ChIP-seq和ChIP-chip数据中识别转录因子靶基因

Bioconductor版本:2.13

ChIPXpress将从ChIPx数据中预测的TF结合基因作为输入,并使用从NCBI GEO下载的相应基因表达谱数据库对TF结合靶点按最有可能是功能TF靶点的基因排序。

作者:George Wu

维护者:George Wu

引文(从R内,输入引用(“ChIPXpress”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ChIPXpress”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ChIPXpress”)

PDF R脚本 ChIPXpress
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学ChIPchipChIPseq软件
版本 1.4.0
在Bioconductor BioC 2.11 (R-2.15)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 2.10),ChIPXpressData
进口 BiobaseGEOqueryfrmaaffybigmemorybiganalytics
链接
建议 mouse4302frmavecsmouse4302.dbmouse4302cdfRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ChIPXpress_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) ChIPXpress_1.4.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ChIPXpress/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPXpress/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心