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这个包是2.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅篮球选手。

基因表达的分析笼(Cap分析)测序数据转录起始点的精确映射和promoterome挖掘

Bioconductor版本:2.13

笼测序数据的预处理,转录起始点的识别和正常化和下游转录起始点的分析集群(发起人)。

作者:Vanja Haberle生物学系,挪威卑尔根大学< Vanja。在bio.uib.no haberle >

维护人员:Vanja Haberle < Vanja。在bio.uib.no haberle >

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PDF	R脚本	篮球选手
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	聚类,HighThroughputSequencing,预处理,测序,软件,转录,可视化
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	方法、R (> = 2.15.0)BSgenome,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
进口	Rsamtools,GenomicRanges,IRanges,data.table,beanplot,rtracklayer,耶鲁大学管理学院,VGAM
链接
建议	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,FANTOM3and4CAGE
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	CAGEr_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	CAGEr_1.4.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	CAGEr_1.4.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/cager/tree/release - 2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAGEr/
包下载报告	下载数据