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此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本，请参见生命网络．

生物网络功能分析的例程

Bioconductor版本:2.13

该软件包提供了蛋白质-蛋白质相互作用网络的集成分析和功能模块的检测功能。通过将统计检验的p值分配给网络节点，可以将不同的数据集集成到网络中。例如，从Affymetrix阵列的基因差异表达中获得的p值被分配给网络的节点。通过拟合β -均匀混合模型并根据p值计算得分，可以计算网络区域的总体得分，并通过整数线性规划算法确定得分最高的子网络。

作者:Marcus Dittrich和Daniela Beisser

维护者:Marcus Dittrich < Marcus。迪特里希在生物中心。uni- wurzburg .de>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BioNet”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“生命网络”)

PDF	R脚本	生命网络教程
PDF		bum1.pdf
PDF		bum2.pdf
PDF		cytoscape.pdf
PDF		prec_recall_large.pdf
PDF		prec_recall_small.pdf
PDF		Tutorial-3dplot.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，DifferentialExpression，GeneExpression，GraphsAndNetworks，微阵列，NetworkAnalysis，NetworkEnrichment，软件
版本	1.23.2
在Bioconductor	BioC 2.7 (R-2.12)(5.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.10.0)，Biobase，图，RBGL
进口	igraph，AnnotationDbi
链接
建议	rgl，嫁祸于，DLBCL，genefilter，xtable，所有，limma，hgu95av2.db，XML
SystemRequirements
增强了
URL	http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
全靠我
进口我	HTSanalyzeR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	BioNet_1.23.2.tar.gz
Windows二进制	BioNet_1.23.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	BioNet_1.23.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/BioNet/tree/release-2.13
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioNet/
软件包下载报告	下载数据