要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ biseq”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

Biseq

该软件包适用于生物导体的2.13版;对于稳定的最新版本,请参阅Biseq

处理和分析硫甘硫酸盐测序数据

生物导体版本:2.13

BISEQ软件包提供了有用的类和功能来处理和分析目标硫酸盐测序(BS)数据,例如减少代表性亚硫酸盐测序(RRBS)数据。特别是,它实现了一种算法以检测差异甲基化区域(DMR)。该软件包从一个或多个示例中获取已经对齐的BS数据。

作者:Katja Hebestreit,Hans-Ulrich Klein

维护者:katja hebestreit

引用(从r内,输入引用(“ Biseq”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biseq”)

PDF R脚本 BISEQ简介
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DNAMETHYLATY,,,,遗传学,,,,高通量序列,,,,甲基,,,,测序,,,,软件
版本 1.2.5
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 LGPL-3
要看 R(> = 2.15.2),方法,iranges(> = 1.17.24),基因组机,,,,公式
进口 方法,生物基因,,,,生物酶,,,,iranges,,,,基因组机,,,,rtracklayer, 平行,betareg,,,,洛克恩,,,,公式,,,,全球测试
链接
建议
系统要求
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包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 biseq_1.2.5.5.tar.gz
Windows二进制 biseq_1.2.5.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) biseq_1.2.5.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/biseq/tree/release-2.13
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biseq/
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