要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayExpressHTS”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

ArrayExpressHTS

此包适用于Bioconductor 2.13版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ArrayExpressHTS

ArrayExpress高通量测序处理流水线

Bioconductor版本:2.13

用于公共ArrayExpress实验或本地数据集的RNA-Seq处理管道

作者:Angela Goncalves, Andrew Tikhonov

维护者:Angela Goncalves

引文(从R内,输入引用(“ArrayExpressHTS”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayExpressHTS”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ArrayExpressHTS”)

PDF R脚本 ArrayExpressHTS: RNA-Seq管道转录分析实验
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews HighThroughputSequencingRNAseq测序软件
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 2.8 (R-2.13)(5年)
许可证 艺术许可2.0
取决于 抽样Rsamtools(> = 1.3.32),
进口 BiobaseBiocGenericsBiostringsDESeqGenomicRangesHmiscIRangesR2HTMLRColorBrewerRsamtoolsShortReadXMLbiomaRt刨边机, grDevices,图形,方法,rJava统计数据,svMisc跑龙套,sendmailRbitops
链接 Rsamtools
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 ArrayExpressHTS_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) ArrayExpressHTS_1.12.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/ArrayExpressHTS/tree/release-2.13
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
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