# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“pasillaBamSubset”)

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pasillaBamSubset。

BAM的子集文件从“Pasilla”实验

Bioconductor版本:2.12

BAM文件untreated1子集。bam(单头读)和untreated3。bam (paired-end读取)从“Pasilla”实验(Pasilla混战,布鲁克斯et al .,基因组研究2011)。看到的小插图pasilla数据包如何untreated1 BAM文件。bam untreated3。bam RNA-Seq读取序列数据的获得是由NCBI基因表达综合下加入数字GSM461176 GSM461181。还包含飞4号染色体的DNA序列读取可以映射。

作者:h .页面

维修工:h .页< hpages fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“pasillaBamSubset”)

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,RNAseqData
版本	0.0.7
许可证	LGPL
取决于
进口
链接
建议	pasilla
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	GenomicFeatures,GenomicRanges,Rsamtools,TransView
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	pasillaBamSubset_0.0.7.tar.gz
Windows二进制	pasillaBamSubset_0.0.7.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	pasillaBamSubset_0.0.7.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pasillaBamSubset/
包下载报告	下载数据