------------------------- o离群值检测:为每个基因的每个样本计算库克距离,矩阵存储在测定列表中。这些值用于确定单个样本不成比例地影响拟合系数的基因。这些基因被标记,p值设置为NA。nbinomWaldTest()和nbinomLRT()的参数'cooksCutoff'可以用来控制这个功能。------------------------ o基类:summarizeexperiment用作存储数据的超类。o工作流:包装器函数DESeq()执行差分表达式分析的所有步骤。单个步骤仍然可以访问。o统计:将先验分布纳入离散度和折叠变化的估计(经验贝叶斯收缩)。缺省推理方法为Wald显著性检验,也可使用之前版本的似然比检验。o归一化:可以提供样本*和基因特异性归一化因子的矩阵