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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅xcms。

LC / MS与GC / MS数据分析

Bioconductor版本:2.12

框架处理和可视化的色谱分离和single-spectra质量的光谱数据。从友邦保险/进口安迪NetCDF、mzXML mzData和mzML文件。高通量的预处理数据,没有针对性分析物分析。

作者:科林·a·史密斯在scripps.edu < csmith >,拉尔夫Tautenhahn < rtautenh scripps.edu >,史蒂芬诺伊曼在ipb-halle.de > < sneumann,保罗·本顿< hpaul。在imperial.ac.uk benton08 >

维护人员:拉尔夫Tautenhahn < rtautenh scripps.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“xcms”)

PDF		FlowChart.pdf
PDF	R脚本	分组与xcms FTICR-MS数据
PDF	R脚本	安装说明xcms
PDF	R脚本	LC / MS与xcms预处理和分析
PDF	R脚本	处理串联和女士与xcms ^ n美元数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.14.0)、方法mzR(> = 1.1.6),BiocGenerics,Biobase
进口
链接
建议	faahKO,msdatancdf,乘,rgl,MassSpecWavelet(> = 1.5.2),RANN,RUnit
SystemRequirements
增强了	Rgraphviz,KEGGSOAP,Rmpi
URL	http://metlin.scripps.edu/download/
取决于我	相机,faahKO,flagme
进口我	相机,Risa
建议我	MassSpecWavelet,msdata,RforProteomics,RMassBank
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	xcms_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	xcms_1.36.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	xcms_1.36.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/xcms/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/xcms/
包下载报告	下载数据