要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见simpleaffy.
Bioconductor版本:2.12
提供高级函数,用于读取Affy . cel文件、表型数据,然后用它计算简单的东西,如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制,用于生成高分辨率的日志数字…
作者:Crispin J Miller
维护者:Crispin Miller
引文(从R内,输入引用(“simpleaffy”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“simpleaffy”)
QCandSimpleaffy.pdf | ||
R脚本 | simpleaffy底漆 | |
参考手册 | ||
文本 | 自述 |
biocViews | 注释,生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,转录,可视化 |
版本 | 2.36.1 |
在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 2.0.0),方法,utils, grDevices,图形,统计,BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase,affy(> = 1.33.6),genefilter,gcrma |
进口 | 方法,utils, grDevices,图形,统计,BiocGenerics,Biobase,affy,genefilter,gcrma |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/ |
全靠我 | yaqcaffy |
进口我 | affyQCReport,arrayMvout,arrayQualityMetrics |
建议我 | AffyExpress,ArrayTools |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | simpleaffy_2.36.1.tar.gz |
Windows二进制 | simpleaffy_2.36.1.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | simpleaffy_2.36.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/simpleaffy/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/simpleaffy/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |