要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

simpleaffy

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见simpleaffy

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

Bioconductor版本:2.12

提供高级函数,用于读取Affy . cel文件、表型数据,然后用它计算简单的东西,如t检验、折叠变化等。大量使用affy库。还具有一些基本的散点图功能和机制,用于生成高分辨率的日志数字…

作者:Crispin J Miller

维护者:Crispin Miller

引文(从R内,输入引用(“simpleaffy”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“simpleaffy”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“simpleaffy”)

PDF QCandSimpleaffy.pdf
PDF R脚本 simpleaffy底漆
PDF 参考手册
文本 自述

细节

biocViews 注释生物信息学DataImportDifferentialExpression微阵列OneChannel预处理质量控制ReportWriting软件转录可视化
版本 2.36.1
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.0.0),方法,utils, grDevices,图形,统计,BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobaseaffy(> = 1.33.6),genefiltergcrma
进口 方法,utils, grDevices,图形,统计,BiocGenericsBiobaseaffygenefiltergcrma
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
全靠我 yaqcaffy
进口我 affyQCReportarrayMvoutarrayQualityMetrics
建议我 AffyExpressArrayTools
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 simpleaffy_2.36.1.tar.gz
Windows二进制 simpleaffy_2.36.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) simpleaffy_2.36.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/simpleaffy/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/simpleaffy/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心