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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅rtracklayer。

基因组浏览器及其注释轨道的R接口

生物导体版本：2.12

可扩展与多个基因组浏览器（目前内置UCSC）交互的框架，并以各种格式（目前GFF，BED，BEDGRAPH，BEDGRAPH，BED15，WIG，WIG，BIGWIG和2位内置）操纵注释轨道。用户可以向/从受支持的浏览器导出/导入跟踪，以及查询并修改浏览器状态，例如当前视口。

作者：迈克尔·劳伦斯，文斯·凯里，罗伯特·绅士

维护者：迈克尔·劳伦斯（Michael Lawrence）

安装

要安装此软件包，请启动R并输入：

##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ rtracklayer”）

文档

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browsevignettes（“ rtracklayer”）

PDF	R脚本	rtracklayer
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	注解，，，，DataImport，，，，软件，，，，可视化
版本	1.20.4
在生物导体中	Bioc 2.2（R-2.7）（8年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.10），方法，基因组机（> = 1.11.12）
进口	XML（> = 1.98-0），生物基因（> = 0.1.0），iranges（> = 1.15.37），基因组机，，，，生物弦（> = 2.25.6），BSGENOME（> = 1.23.1），Zlibbioc，，，，rcurl（> = 1.4-2），rsamtools（> = 1.7.3）
链接	iranges
建议	人类系统，，，，microRNA（> = 1.1.1），GeneFilter，，，，林玛，，，，org.hs.eg.db，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，hgu133plus2.db
系统要求
增强
URL
取决于我	腹带，，，，Eatonetalchipseq，，，，htseqgenie，，，，甲基赛克，，，，R3CSEQ，，，，Ripseeker
进口我	Biseq，，，，卡格，，，，ChromheatMap，，，，FDB.Infinium -Methylation.hg18，，，，FDB.Infinium -Methylation.hg19，，，，funcisnp，，，，funcisnp.data，，，，Genelendatabase，，，，GenomicFeatures，，，，GGBIO，，，，GMAPR，，，，GVIZ，，，，HITC，，，，htseqgenie，，，，Medips，，，，甲基分析，，，，主题，，，，R453plus1toolbox，，，，变体工具
建议我	Biovizbase，，，，fdb.fantom4.promoters.hg19，，，，GenomicFeatures，，，，基因组机，，，，ggtut，，，，Goseq，，，，GVIZ，，，，Gwascat，，，，HITC，，，，Ind1kg，，，，甲基菌，，，，动机，，，，狭窄，，，，Onechannelgui，，，，图片，，，，ping，，，，准，，，，R453plus1toolbox，，，，repitools，，，，林戈，，，，rmat，，，，RSVSIM，，，，三元，，，，TSSI
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源	rtracklayer_1.20.4.4.tar.gz
Windows二进制	rtracklayer_1.20.4.4.zip（32-和64位）
Mac OS X 10.6（雪豹）	rtracklayer_1.20.4.tgz
颠覆源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/bioconductor-mirror/rtracklayer/tree/release-2.12
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/rtracklayer/
软件包下载报告	下载统计