要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qpgraph”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

qpgraph

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见qpgraph

分子调控网络的qp图逆向工程

Bioconductor版本:2.12

q阶偏相关图,简称qp图,是由q阶偏相关建立的无向高斯图马尔可夫模型。它们对于从随机变量p的数量超过可用样本容量n的数据集中学习无向图形高斯马尔可夫模型非常有用,例如,在微阵列数据的情况下,它们可以用于逆向工程分子调控网络。

作者:R. Castelo和A. Roverato

维护者:Robert Castelo < Robert。Castelo在upf.edu>

引文(从R内,输入引用(“qpgraph”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“qpgraph”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“qpgraph”)

PDF BasicUsersGuide.pdf
PDF R脚本 利用qpgraph对转录调控网络进行逆向工程
PDF R脚本 利用qpgraph模拟分子调控网络
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneRegulationGraphsAndNetworks微阵列NetworkInference通路软件转录
版本 1.16.3
在Bioconductor BioC 2.4 (R-2.9)(7年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 2.14.0)
进口 方法,矩阵(>= 1.0),图形,注释(> = 1.37.6),BiobaseGGBaseAnnotationDbimvtnormqtlRgraphviz
链接
建议 genefilterorg.EcK12.eg.db
SystemRequirements
增强了 rlecuyer类别GOstats
URL http://functionalgenomics.upf.edu/qpgraph
全靠我
进口我 限幅器
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 qpgraph_1.16.3.tar.gz
Windows二进制 qpgraph_1.16.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) qpgraph_1.16.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/qpgraph/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心