安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phenoTest”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

phenoTest

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅phenoTest

工具来测试基因表达和表型之间的联系的方式高效、结构化、快速和可伸缩的。我们还提供了工具来做GSEA(基因集富集分析)和拷贝数变异。

Bioconductor版本:2.12

工具来测试基因表达之间的相关性和表型的方式高效、结构化、快速和可伸缩的。GSEA也提供。

作者:Evarist星球

维护人员:< Evarist Evarist行星。地球在irbbarcelona.org >

从内部引用(R,回车引用(“phenoTest”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phenoTest”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“phenoTest”)

PDF R脚本 手册phenoTest图书馆
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学,分类,聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,软件
版本 1.8.1
Bioconductor自 BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.12.0),Biobase、方法、注释,Heatplus,BMA
进口 生存,limma,Hmisc,gplots,类别,AnnotationDbi,hopach,biomaRt,GSEABase,genefilter,xtable,注释,mgcv,SNPchip,hgu133a.db,HTSanalyzeR
链接
建议 GSEABase,KEGG.db,GO.db
SystemRequirements
增强了 平行,org.Ce.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Dm.eg.db
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 phenoTest_1.8.1.tar.gz
Windows二进制 phenoTest_1.8.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) phenoTest_1.8.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/phenotest/tree/release - 2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/phenoTest/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心