安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phenoTest”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅phenoTest。
Bioconductor版本:2.12
工具来测试基因表达之间的相关性和表型的方式高效、结构化、快速和可伸缩的。GSEA也提供。
作者:Evarist星球
维护人员:< Evarist Evarist行星。地球在irbbarcelona.org >
从内部引用(R,回车引用(“phenoTest”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“phenoTest”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“phenoTest”)
R脚本 | 手册phenoTest图书馆 | |
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,分类,聚类,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,软件 |
版本 | 1.8.1 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.12.0),Biobase、方法、注释,Heatplus,BMA |
进口 | 生存,limma,Hmisc,gplots,类别,AnnotationDbi,hopach,biomaRt,GSEABase,genefilter,xtable,注释,mgcv,SNPchip,hgu133a.db,HTSanalyzeR |
链接 | |
建议 | GSEABase,KEGG.db,GO.db |
SystemRequirements | |
增强了 | 平行,org.Ce.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Hs.eg.db,org.Dm.eg.db |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | phenoTest_1.8.1.tar.gz |
Windows二进制 | phenoTest_1.8.1.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | phenoTest_1.8.1.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/phenotest/tree/release - 2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/phenoTest/ |
包下载报告 | 下载数据 |