要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“minfi”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

minfi

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见minfi

分析Illumina公司的450k甲基化阵列

Bioconductor版本:2.12

用于分析和可视化Illumina的45万阵列数据的工具

作者:Kasper Daniel Hansen, Martin Aryee

维护者:Kasper Daniel Hansen

引文(从R内,输入引用(“minfi”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“minfi”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“minfi”)

PDF R脚本 Minfi指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DNAMethylationDataImport微阵列预处理质量控制软件TwoChannel
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),晶格重塑GenomicRangesBiostrings,跑龙套
进口 BiocGenericsbeanplotRColorBrewernor1mixsiggeneslimmapreprocessCoreilluminaiomatrixStatsmclust
链接
建议 IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),minfiData(> = 0.2.0),RUnit消化
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 IlluminaHumanMethylation27kmanifestIlluminaHumanMethylation450kannotation.ilmn.v1.2IlluminaHumanMethylation450kmanifestminfiData
进口我 methylumi
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 minfi_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 minfi_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) minfi_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/minfi/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/minfi/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心