要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“minfi”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见minfi.
Bioconductor版本:2.12
用于分析和可视化Illumina的45万阵列数据的工具
作者:Kasper Daniel Hansen, Martin Aryee
维护者:Kasper Daniel Hansen
引文(从R内,输入引用(“minfi”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“minfi”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“minfi”)
R脚本 | Minfi指南 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DNAMethylation,DataImport,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | 方法,BiocGenerics(> = 0.3.2),Biobase(> = 2.17.8),晶格,重塑,GenomicRanges,Biostrings,跑龙套 |
进口 | BiocGenerics,beanplot,RColorBrewer,nor1mix,siggenes,limma,preprocessCore,illuminaio,matrixStats,mclust |
链接 | |
建议 | IlluminaHumanMethylation450kmanifest(> = 0.2.0),minfiData(> = 0.2.0),RUnit,消化 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | IlluminaHumanMethylation27kmanifest,IlluminaHumanMethylation450kannotation.ilmn.v1.2,IlluminaHumanMethylation450kmanifest,minfiData |
进口我 | methylumi |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | minfi_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | minfi_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | minfi_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/minfi/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/minfi/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |