要安装此软件包，请启动R并输入：
##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ gmapr”）
在大多数情况下，您根本不需要下载包装存档。
GMAPR
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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅GMAPR。
提供了便利的方法，可以从R内部使用GMAP和GSNAP
生物导体版本：2.12
GSNAP和GMAP是一对可以对齐Tom Wu编写的短阅读数据的工具。该软件包提供了与GMAP和GSNAP一起使用的便利方法。此外，它还提供了使用BAM_TALLY工具以每核苷酸为基础进行对齐结果的方法。
作者：Cory Barr，Thomas Wu，Michael Lawrence
维护者：迈克尔·劳伦斯（Michael Lawrence）
引用（从r内，输入引用（“ gmapr”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ gmapr”）
文档
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browsevignettes（“ gmapr”）
| R脚本 | GMAPR | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.11（R-2.15）（3。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 2.15.0），方法，基因组机 |
| 进口 | iranges，，，，rsamtools（> = 1.7.4），rtracklayer（> = 1.17.15），基因组机，，，，GenomicFeatures，，，，生物弦，，，，变体， 工具，生物酶，，，，BSGENOME |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3，，，，变体，，，，org.hs.eg.db，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，肺部 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | htseqgenie |
| 进口我 | 变体工具 |
| 建议我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | gmapr_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/gmapr/tree/release-2.12 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gmapr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
