要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genefilter”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的2.12版;对于稳定的最新版本,请参阅GeneFilter。
生物导体版本:2.12
过滤基因的一些基本功能
作者:R。Gentleman,V。Carey,W。Huber,F。Hahne
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“基因词”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ genefilter”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ GeneFilter”)
R脚本 | 其他图:独立过滤增加了检测差异表达基因的功率,Bourgon等人,PNAS(2010) | |
R脚本 | 独立过滤的诊断 | |
R脚本 | 如何找到表达谱类似于指定基因的基因 | |
R脚本 | 使用GeneFilter函数从微阵列数据集过滤基因 | |
参考手册 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,微阵列,,,,软件 |
版本 | 1.42.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | |
进口 | AnnotationDbi,,,,注释(> = 1.13.7),生物酶(> = 1.99.10),图形,方法,统计,生存 |
链接 | |
建议 | 生物酶(> = 1.99.10),班级,,,,HGU95AV2.DB, 方法,tkwidgets,,,,全部,,,,鹏,,,,deseq,,,,帕西拉 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | A4base,,,,AGI4X44PRECESS,,,,Cellhts,,,,CellHTS2,,,,魅力,,,,cntools,,,,Genemeta,,,,mlinterfaces,,,,简单 |
进口我 | Affycoretools,,,,Affyqcreport,,,,Annmap,,,,ArrayQualityMetrics,,,,类别,,,,deseq,,,,deseq2,,,,Eisa,,,,GCMAP,,,,GGBASE,,,,GSRI,,,,甲基分析,,,,甲基菌,,,,表,,,,林戈,,,,rnainteractmapk,,,,简单,,,,蒂格拉里,,,,XDE |
建议我 | AffyExpress,,,,注释,,,,Arraytools,,,,生物探测,,,,Bionet,,,,类别,,,,类别Compare,,,,簇,,,,codelink,,,,策展人,,,,雌激素,,,,事实设计,,,,FFPE,,,,ffpeexampledata,,,,Gagedata,,,,gostats,,,,gsealm,,,,GSVA,,,,逻辑,,,,Lumi,,,,maqcsubset,,,,mcrestimate,,,,奥利戈,,,,Onechannelgui,,,,门索,,,,PVAC,,,,qpgraph,,,,风湿性调节wollbold,,,,rtracklayer,,,,siggenes,,,,SSPA,,,,topgo,,,,香草,,,,XDE |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | genefilter_1.42.0.tar.gz |
Windows二进制 | genefilter_1.42.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | genefilter_1.42.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/genefilter/tree/release-2.12 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/genefilter/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |