# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ensemblVEP”)

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ensemblVEP。

R接口运用变异效果预测

Bioconductor版本:2.12

通过perl API查询运用变异效果预测

作者:瓦莱丽Obenchain < vobencha fhcrc.org >,

维护人员:瓦莱丽Obenchain < vobencha fhcrc.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ensemblVEP”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ensemblVEP”)

PDF	R脚本	ensemblVEP
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	注释,生物信息学,软件
版本	1.0.5
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,BiocGenerics,GenomicRanges,VariantAnnotation
进口	Biostrings,IRanges
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements	运用(API版本73)和Perl包DBD:: mysql必须安装。看到包的README和运用网站http://www.ensembl.org/info/docs/variation/vep/index.html的安装说明。
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ensemblVEP_1.0.5.tar.gz
Windows二进制	ensemblVEP_1.0.5.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	ensemblVEP_1.0.5.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/ensemblvep/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ensemblVEP/
包下载报告	下载数据