##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“edgeR”)

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见刨边机．

R .基因数字表达数据的实证分析

Bioconductor版本:2.12

RNA-seq和数字基因表达谱与生物复制的差异表达分析。使用经验贝叶斯估计和基于负二项分布的精确检验。也可用于与其他类型的基因组规模计数数据的差分信号分析。

作者:Mark Robinson ， Davis McCarthy ，陈云顺， Aaron Lun ， Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

维护人:Mark Robinson ， Davis McCarthy ， Yunshun Chen ， Gordon Smyth < Smyth at wehi.edu.au>

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“edgeR”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(磨边机)

PDF	R脚本	磨边机装饰图案
PDF		edgeRUsersGuide.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学，ChIPseq，DifferentialExpression，HighThroughputSequencing，RNAseq，圣人，软件
版本	3.2.4
在Bioconductor	BioC 2.3 (R-2.8)(7.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(>= 2.15.0)，方法，limma
进口
链接
建议	质量，statmod样条函数,locfit，KernSmooth
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	DBChIP，easyRNASeq，外套
进口我	ArrayExpressHTS，DiffBind，HTSFilter，MEDIPS，Repitools，ReportingTools，rnaSeqMap，tweeDEseq
建议我	baySeq，BitSeq，cqn，EDASeq，GenomicRanges，goseq，GSVA，leeBamViews，oneChannelGUI，pasilla，Repitools，SSPA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	edgeR_3.2.4.tar.gz
Windows二进制	edgeR_3.2.4.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	edgeR_3.2.4.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/edgeR/tree/release-2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/edgeR/
软件包下载报告	下载数据