安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“domainsignatures”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅domainsignatures。
Bioconductor版本:2.12
找到显著富集基因分类的列表功能的基因根据InterPro域结构。
作者:蒂姆Beissbarth哈恩(Florian Hahne)
维护人员:Florian Hahne <弗洛里安。在novartis.com hahne >
从内部引用(R,回车引用(“domainsignatures”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“domainsignatures”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“domainsignatures”)
R脚本 | 使用InterPro域特征基因集富集 | |
参考手册 |
biocViews | 注释,GeneSetEnrichment,通路,软件 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.3 (r - 2.8)(7.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(> =测试盒框),KEGG.db,普拉达,biomaRt、方法 |
进口 | AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | domainsignatures_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | domainsignatures_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | domainsignatures_1.20.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/domainsignatures/tree/release - 2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/domainsignatures/ |
包下载报告 | 下载数据 |