要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ chimera”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

嵌合体

该软件包适用于生物导体的2.12版;对于稳定的最新版本,请参阅嵌合体

用于融合产品的辅助分析的包装

生物导体版本:2.12

该软件包有助于融合产品事件的表征。它允许从以下融合查找器导入融合数据:钟形曲线,变形,融合芬德,融合hunter,mapsplice,tophat-fusion,fusionmap

作者:Raffaele A Calogero,Matteo Carrara,Marco Beccuti,Francesca Cordero

维护者:raffaele a calogero

引用(从r内,输入引用(“嵌合体”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ chimera”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“嵌合体”)

PDF R脚本 嵌合体
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基础设施,,,,软件
版本 1.2.6
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(3年)
执照 艺术2.0
要看 生物酶,,,,基因组机,,,,rsamtools, 方法,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,AnnotationDbi,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
进口
链接
建议 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9,,,,txdb.mmusculus.ucsc.mm9
系统要求 某些功能需要Tophat,Bowtie和Samtools
增强 rsubread
URL
取决于我 Onechannelgui
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Chimera_1.2.6.tar.gz
Windows二进制 Chimera_1.2.6.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) Chimera_1.2.6.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/chimera/tree/release-2.12
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/chimera/
软件包下载报告 下载统计

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