要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cellHTS2”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

cellHTS2

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见cellHTS2

细胞筛选的分析。cellHTS的修订版

Bioconductor版本:2.12

该软件包为384孔微量滴定板(或类似)格式的高通量分析提供了分析工具。功能包括数据导入和管理、规范化、质量评估、复制摘要和统计评分。生成一个网页,提供数据和分析结果的详细图形概述。在我们的工作中,我们已经将该包应用于苍蝇和人类细胞的RNAi筛选,以及酵母文库的筛选。参见?cellHTS2获得简要介绍。

作者:Ligia Bras, Wolfgang Huber , Michael Boutros , Gregoire Pau , Florian Hahne < Florian。Hahne在novarti.com >

维护者:Joseph Barry < Joseph。Barry在embl.de>

引文(从R内,输入引用(“cellHTS2”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“cellHTS2”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“cellHTS2”)

PDF R脚本 主要插图(完整版本):基于单元格的屏幕的端到端分析
PDF R脚本 主要插图:基于单元的屏幕的端到端分析
PDF R脚本 补充:增强-抑制筛选
PDF R脚本 补充:多通道测定
PDF 参考手册

细节

biocViews CellBasedAssays,预处理,软件,可视化
版本 2.24.1
在Bioconductor BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10),RColorBrewer,Biobase、方法、genefilter,splots,vsn,hwriter,locfit、网格
进口 普拉达,GSEABase,类别, stats4
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL http://www.dkfz.de/signalinghttp://www.ebi.ac.uk/huber
全靠我 coRNAi,imageHTS,staRank
进口我 HTSanalyzeR,RNAinteract
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 cellHTS2_2.24.1.tar.gz
Windows二进制 cellHTS2_2.24.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) cellHTS2_2.24.1.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/cellHTS2/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/cellHTS2/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心