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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅卡斯珀。

描述基于Paired-End可变剪接的读取

Bioconductor版本:2.12

推断出可变剪接从paired-end RNA-seq数据。跨外显子模型是基于计算路径,而不是成对外显子连接,并估计片段大小和分布non-parametrically开始,提高估计精度。

作者:大卫•Rossell卡米尔Stephan-Otto曼努埃尔Kroiss

维护人员:大卫Rossell < rosselldavid gmail.org >

安装

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文档

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PDF	R脚本	卡斯珀图书馆手册
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,DifferentialExpression,GeneExpression,HighThroughputSequencing,RNASeq,软件,转录
版本	1.1.2
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.14.1),Biobase,IRanges、方法、gtools,GenomicRanges,Rsamtools,plyr,gaga
进口	VGAM,mgcv,GenomicFeatures,生存,sqldf
链接
建议
SystemRequirements
增强了	平行
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	casper_1.1.2.tar.gz
Windows二进制	casper_1.1.2.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	casper_1.1.2.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/casper/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/casper/
包下载报告	下载数据