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此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见arrayQualityMetrics．

微阵列数据集的质量度量

Bioconductor版本:2.12

这个包为Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet, AffyBatch)中的数据生成微阵列质量度量报告。报告包含一般和特定于平台的部分。支持单色和双色阵列平台。

作者:奥黛丽·考夫曼，沃尔夫冈·胡贝尔

维护者:Audrey Kauffmann

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“arrayQualityMetrics”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“arrayQualityMetrics”)

PDF	R脚本	高级主题:自定义arrayQualityMetrics报告和输出的编程处理
PDF	R脚本	简介:使用arrayQualityMetrics进行微阵列质量评估
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，质量控制，ReportWriting，软件，TwoChannel
版本	3.16.0
在Bioconductor	BioC 2.1 (R-2.6)(8.5年)
许可证	LGPL (>= 2)
取决于
进口	affy，affyPLM(> = 1.27.3),beadarray，Biobase，开罗(> = 1.4 6),genefilter，图形，grDevices，网格，Hmisc，hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、RColorBrewer，setRNG，simpleaffy，属性，SVGAnnotation (>= 0.9-0)， utils，vsn(> = 3.23.3),XML
链接
建议	ALLMLL，亚兰
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	arrayQualityMetrics_3.16.0.tar.gz
Windows二进制	arrayQualityMetrics_3.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	arrayQualityMetrics_3.16.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/arrayQualityMetrics/tree/release-2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/
软件包下载报告	下载数据