要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affyQCReport”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见affyQCReport.
Bioconductor版本:2.12
这个包为AffyBatch对象创建一个QC报告。该报告旨在允许用户快速评估AffyBatch对象中一组数组的质量。
作者:Craig Parman < Craig。帕尔曼在bifx.org>,Conrad Halling
维护者:Craig Parman < Craig。帕尔曼在bifx.org>
引文(从R内,输入引用(“affyQCReport”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affyQCReport”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“affyQCReport”)
R脚本 | affyQCReport:生成Affymetrix QC报告的方法 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,OneChannel,质量控制,软件 |
版本 | 1.38.0 |
在Bioconductor | BioC 1.7 (R-2.2)(10.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2) |
取决于 | Biobase(> = 1.13.16),affy,晶格 |
进口 | affy,affyPLM,Biobase,genefilter,图形,grDevices,晶格,RColorBrewer,simpleaffy,统计,utils,xtable |
链接 | |
建议 | tkWidgets(> = 1.5.23),affydata(> = 1.4.1) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | BiocCaseStudies |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | affyQCReport_1.38.0.tar.gz |
Windows二进制 | affyQCReport_1.38.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | affyQCReport_1.38.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/affyQCReport/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/affyQCReport/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |