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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affy。

方法Affymetrix寡核苷酸阵列

Bioconductor版本:2.12

包包含用于探索性寡核苷酸阵列分析功能。依赖tkWidgets只关注一些方便的功能。“affy”是没有它功能齐全。

作者:拉斐尔·a·伊<拉法在jhu.edu >, Laurent Gautier < lgautier gmail.com >,本杰明·米洛Bolstad < bmb bmbolstad.com >,和< cmiller Crispin米勒picr.man.ac。英国的贡献> Magnus搁浅地<马格努斯。搁浅地在astrazeneca.com >,莱斯利·m·应对< mts.jhu.edu >,罗伯特先生,杰夫绅士,康拉德哈林舞< agilixcorp.com >们聊天,沃尔夫冈•休伯詹姆斯•麦克唐纳< jmacdon med.umich.edu >本杰明·i·鲁宾斯坦克里斯托弗工人cbs.dtu <工人。dk >,约翰

维护人员:拉斐尔·a·伊<拉法在jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“affy”)

PDF	R脚本	1。底漆
PDF	R脚本	2。内置的处理方法
PDF	R脚本	3所示。自定义处理方法
PDF	R脚本	4所示。导入方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,预处理,软件
版本	1.38.1
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 2.8.0),BiocGenerics(> = 0.1.12),Biobase(> = 2.5.5)
进口	BiocGenerics,Biobase,affyio(> = 1.13.3),BiocInstaller、图形grDevices、方法preprocessCore,统计,跑龙套,zlibbioc
链接	preprocessCore
建议	tkWidgets(> = 1.19.0),affydata,widgetTools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	affyContam,affycoretools,affydata,AffyExpress,affylmGUI,affylmGUI,affyPara,affypdnn,affyPLM,affyQCReport,AffyRNADegradation,AgiMicroRna,ALLMLL,altcdfenvs,AmpAffyExample,arrayMvout,ArrayTools,bgx,bronchialIL13,ccTutorial,慢性淋巴细胞白血病,Cormotif,curatedOvarianData,DrugVsDisease,dualKS,ecoliLeucine,雌激素,ExiMiR,农场,frmaTools,gcrma,LMGene,logitT,LVSmiRNA,时间的,MAQCsubset,MAQCsubsetAFX,maskBAD,中长期规划,mvoutData,panp,plw,prebs,PREDAsampledata,彪马,pumadata,qpcrNorm,ReadqPCR,RefPlus,rHVDM,Risa,战,simpleaffy,SpikeIn,SpikeInSubset,sscore,斯塔尔,webbioc,XhybCasneuf
进口我	affyILM,affyQCReport,AffyTiling,ArrayExpress,arrayQualityMetrics,ArrayTools,ChIPXpress,Cormotif,农场,ffpe,frma,gcrma,GEOsubmission,Harshlight,HTqPCR,光民,makecdfenv,MSnbase,钳子,plw,彪马,pvac,simpleaffy,tilingArray,TurboNorm,virtualArray,vsn,waveTiling
建议我	AnnotationForge,beadarray,beadarraySNP,BiocCaseStudies,Biostrings,BufferedMatrixMethods,categoryCompare,ecolitk,雌激素,ExpressionView,factDesign,ffpe,ffpeExampleData,gCMAPWeb,GeneRegionScan,limma,made4,oneChannelGUI,钢琴,PREDA,siggenes,TurboNorm
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	affy_1.38.1.tar.gz
Windows二进制	affy_1.38.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	affy_1.38.1.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/affy/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affy/
包下载报告	下载数据