安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“affxparser”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

affxparser

这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affxparser

Affymetrix SDK文件解析

Bioconductor版本:2.12

包解析Affymetrix文件(CDF,玻璃纸,共和人民党,BPMAP, BAR)。它提供了快速和内存高效方法解析Affymetrix文件使用Affymetrix融合的SDK。ASCII和基于二进制的文件支持。目前,有方法阅读芯片定义文件(CDF)和细胞强度文件(移动电话)。这些文件可以读取全部或部分。例如,探针信号从几probesets可以很快从一个组移动电话文件提取到一个方便的列表结构。

作者:亨利克·本特松,布拉德,罗伯特先生,丹尼尔•汉森Kasper马丁摩根

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< khansen jhsph.edu >

从内部引用(R,回车引用(“affxparser”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“affxparser”)

文档

PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,基础设施,软件
版本 1.32.3
Bioconductor自 BioC 1.7 (r - 2.2)(10.5年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.6.0)
进口
链接
建议 R.utils(> = 1.19.5),AffymetrixDataTestFiles
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 斜体,pdInfoBuilder,rMAT,斯塔尔
进口我 affyILM,AffyTiling,cn.farms,GeneRegionScan,斜体,益生元,rMAT
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 affxparser_1.32.3.tar.gz
Windows二进制 affxparser_1.32.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) affxparser_1.32.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/affxparser/tree/release - 2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affxparser/
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Bioconductor

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支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
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