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变体
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该软件包适用于生物导体的2.12版；对于稳定的最新版本，请参阅变体。
遗传变异的注释
生物导体版本：2.12
注释变体，计算氨基酸编码变化，预测编码结果
作者：Valerie Obenchain，Martin Morgan，Michael Lawrence，来自Stephanie Gogarten的贡献。
维护者：valerie obenchain
引用（从r内，输入引用（“变体”））：
安装
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文档
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browsevignettes（“变体”）
| R脚本 | FilterVCF概述 | |
| R脚本 | 变体介绍 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 注解，，，，DataImport，，，，遗传学，，，，高通量序列，，，，homo_sapiens，，，，SNP，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.8 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（4。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 2.8.0），方法，生物基因，，，，基因组机（> = 1.11.29），rsamtools（> = 1.11.26），iranges（> = 1.17.4） |
| 进口 | 方法，生物基因，，，，iranges，，，，生物弦，，，，生物酶，，，，rsamtools，，，，AnnotationDbi（> = 1.17.11），Zlibbioc，，，，BSGENOME，，，，GenomicFeatures（> = 1.9.35），DBI，UTILS |
| 链接 | iranges，，，，生物弦，，，，rsamtools |
| 建议 | 运行，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg19，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp.20101109，，，，sift.hsapiens.dbsnp132，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，snpstats，，，，GGPLOT2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | CGDV17，，，，ememblvep，，，，polyphen.hsapiens.dbsnp131，，，，sift.hsapiens.dbsnp132，，，，变体工具 |
| 进口我 | funcisnp，，，，GGBIO，，，，ggtools，，，，GMAPR，，，，htseqgenie，，，，R453plus1toolbox，，，，变体工具 |
| 建议我 | 基因组机，，，，GMAPR，，，，Gwastools |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 包源 | variantAnnotation_1.6.8.tar.gz |
| Windows二进制 | variantantation_1.6.8.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.6（雪豹） | variantantation_1.6.8.tgz |
| 颠覆源 | （用户名/密码：ReadOnly） |
| git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/variantannotation/tree/release-2.12 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/variantannotation/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
