要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ vanillaice”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

香草

该软件包适用于生物导体的2.12版;对于稳定的最新版本,请参阅香草

高通量基因分型阵列的隐藏马尔可夫模型

生物导体版本:2.12

隐藏的马尔可夫模型,用于表征高吞吐量SNP数组中的染色体改变

作者:jhsph.edu>,kevin Scharpf和ingo ruczinski

维护者:jhsph.edu>的Robert Scharpf

引用(从r内,输入引用(“香草”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ vanillaice”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Vanillaice”)

PDF R脚本 crlmmdownstream
PDF R脚本 Vanillaice Vignette
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物信息学,,,,库务,,,,遗传因素,,,,SNP,,,,软件,,,,可视化
版本 1.22.0
在生物导体中 Bioc 2.1(R-2.6)(8。5年)
执照 LGPL-2
要看 R(> = 2.14.0)
进口 统计,utils,方法,生物酶,,,,寡群(> = 1.21.12),格子,,,,iranges(> = 1.13.22),网格,MSM,,,,迭代器,,,,foreach,,,,基因组机,,,,矩阵
链接
建议 Genomewidenp6crlmm(> = 1.0.7),hapmapsnp6,,,,rcolorbrewer,,,,GeneFilter,,,,rsqlite,,,,foreach,,,,运行,,,,pd.mapping50k.hind240,,,,Snpchip(> = 2.5.7),Dosnow
系统要求
增强 DNACOPIGY,,,,crlmm(> = 1.17.14)
URL
取决于我
进口我 最小值
建议我 寡群
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 Vanillaice_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 Vanillaice_1.22.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) Vanillaice_1.22.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/vanillaice/tree/release-2.12
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/vanillaice/
软件包下载报告 下载统计

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