要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ringo”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

林戈

该软件包适用于生物导体的2.12版;对于稳定的最新版本,请参阅林戈

R调查芯片芯片寡聚架

生物导体版本:2.12

包装铃声促进了芯片芯片数据的主要分析。包装的主要功能是数据读数,质量评估,数据可视化和基因组区域的识别,显示了CHIP-CHIP中的富集。该软件包具有处理芯片芯片项目中使用的Nimblegen的两色寡核苷酸微阵列的功能,但鉴于数据以RGLIST(RGLIST(RAW)或expressionset(pre-pre-pre-predionset)提供(pre-pre-prectionset)(pre-chip-chip数据分析)(pre-chip-chip数据分析)(处理)。该软件包采用了来自生物导体项目的其他各种软件包的功能,并提供了其他芯片芯片特异性和敏捷特异性功能。

作者:Joern Toedling,Oleg Sklyar,Tammo Krueger,Matt Ritchie,Wolfgang Huber

维护者:J。toedling

引用(从r内,输入引用(“林戈”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ringo”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Ringo”)

PDF R脚本 r对敏捷寡聚的调查
PDF 参考手册

细节

生物浏览 DataImport,,,,微阵列,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件,,,,两通道
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(9年)
执照 艺术2.0
要看 方法,生物酶(> = 1.14.1),rcolorbrewer,,,,林玛,,,,矩阵, 网格
进口 生物基因(> = 0.1.11),GeneFilter,,,,林玛,,,,VSN,Stats4
链接
建议 rtracklayer(> = 1.3.1),mclust,,,,topgo(> = 1.15.0)
系统要求
增强
URL
取决于我 CCTORIAL,,,,斯塔尔
进口我 repitools
建议我 repitools
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 ringo_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 ringo_1.24.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹) ringo_1.24.0.tgz
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/ringo/tree/release-2.12
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ringo/
软件包下载报告 下载统计

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