要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“阅读器”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

红色的

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红色的

交互式可视化和嵌套网络的操作。

Bioconductor版本:2.12

RedeR是一个基于r的包,结合了一个独立的Java应用程序,用于模块化结构、嵌套网络和多层层次关联的交互式可视化和操作。它通过使用低级的R-to-Java接口来构建和运行公共插件来实现回调引擎。从这个意义上说,RedeR利用R来运行健壮的统计,而R-to- java接口弥合了网络分析和可视化之间的差距。

作者:Mauro Castro, Wang Xin, Florian Markowetz

维护者:Mauro Castro < Mauro .a.。卡斯特罗在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“红”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“阅读器”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“红”)

PDF fig1.pdf
PDF fig2.pdf
PDF fig3.pdf
PDF fig4.pdf
PDF fig5a.pdf
PDF fig5b.pdf
PDF fig5c.pdf
PDF fig6.pdf
PDF R脚本 主要插图:阅读器概述
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GraphsAndNetworksNetworkVisualization网络软件可视化
版本 1.8.3
在Bioconductor BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R(>= 2.15),方法,igraph
进口 RCurlXMLXMLRPC,rJava
链接
建议 JavaGDPANRpvclust
SystemRequirements
增强了
URL http://genomebiology.com/2012/13/4/R29
全靠我
进口我 Mulder2012
建议我 PANR
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 RedeR_1.8.3.tar.gz
Windows二进制 RedeR_1.8.3.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) RedeR_1.8.3.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/RedeR/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RedeR/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心