要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“阅读器”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见红色的.
Bioconductor版本:2.12
RedeR是一个基于r的包,结合了一个独立的Java应用程序,用于模块化结构、嵌套网络和多层层次关联的交互式可视化和操作。它通过使用低级的R-to-Java接口来构建和运行公共插件来实现回调引擎。从这个意义上说,RedeR利用R来运行健壮的统计,而R-to- java接口弥合了网络分析和可视化之间的差距。
作者:Mauro Castro, Wang Xin, Florian Markowetz
维护者:Mauro Castro < Mauro .a.。卡斯特罗在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“红”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“阅读器”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“红”)
fig1.pdf | ||
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R脚本 | 主要插图:阅读器概述 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GraphsAndNetworks,NetworkVisualization,网络,软件,可视化 |
版本 | 1.8.3 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | R(>= 2.15),方法,igraph |
进口 | RCurl,XMLXMLRPC,rJava |
链接 | |
建议 | JavaGD,PANR,pvclust |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://genomebiology.com/2012/13/4/R29 |
全靠我 | |
进口我 | Mulder2012 |
建议我 | PANR |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | RedeR_1.8.3.tar.gz |
Windows二进制 | RedeR_1.8.3.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | RedeR_1.8.3.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/RedeR/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RedeR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |