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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅REDseq。

高通量测序数据的分析处理限制性内切酶消化

Bioconductor版本:2.12

包包含函数建立限制酶切位点(RECS)地图,分发映射序列与五种不同的方法,在地图上找到丰富/耗尽推荐一个样本,识别不同浓缩/耗尽样本之间的推荐。

作者:丽华朱莉朱镕基和托马斯Fazzio

维护人员:丽华朱莉朱<朱莉。朱:umassmed.edu >

安装

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PDF	R脚本	REDseq装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	预处理,SequenceMatching,测序,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(4.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.15.0),BiocGenerics(> = 0.1.0),BSgenome.Celegans.UCSC.ce2,乘,Biostrings,BSgenome,ChIPpeakAnno
进口	BiocGenerics,AnnotationDbi,Biostrings,ChIPpeakAnno、图形、IRanges(> = 1.13.5),乘统计,跑龙套
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	REDseq_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	REDseq_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	REDseq_1.6.0.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/redseq/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/REDseq/
包下载报告	下载数据