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这个包是2.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅QuasR。

量化和注释在短时间内读取R

Bioconductor版本:2.12

这个包提供了一个框架的量化和分析短的读取。它涵盖了一个完整的工作流从原始序列读取,校准和质量控制图的创建,量化的基因组区域。

作者:安妮塔,我们针对Dimos Gaiditzis和迈克尔·施

维护人员:迈克尔Stadler <迈克尔。施在fmi.ch >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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PDF	R脚本	介绍QuasR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPseq,遗传学,HighThroughputSequencing,Methylseq,预处理,RNAseq,软件
版本	1.0.9
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(3年)
许可证	GPL-2
取决于	R(> = 2.15.0),并行,GenomicRanges,Rbowtie(> = 0.99.0)
进口	方法,zlibbioc,BiocGenerics,IRanges,BiocInstaller,Biobase,Biostrings,GenomicRanges,BSgenome,Rsamtools,GenomicFeatures,ShortRead
链接	Rsamtools
建议	Rsamtools,rtracklayer,Gviz,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	QuasR_1.0.9.tar.gz
Windows二进制	QuasR_1.0.9.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)	QuasR_1.0.9.tgz
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/quasr/tree/release - 2.12
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/QuasR/
包下载报告	下载数据