要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PAPi”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见爸爸.
Bioconductor版本:2.12
途径活性谱(PAPi)是一个R包,用于预测代谢途径的活性,仅基于代谢组学数据集,其中包含已识别的代谢物列表及其在不同生物样品中的各自丰度。PAPi产生了改善最终生物学解释的假设。见阿乔,r.b.m.;Ruggiero, K.和Villas-Boas, S.G.(2010) -途径活性谱(PAPi):从代谢物谱到代谢途径活性。生物信息学。
作者:拉斐尔·阿乔
维护者:拉斐尔·阿乔<拉斐尔。Aggio在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“爸爸”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PAPi”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“爸爸”)
R脚本 | 应用爸爸 | |
PAPi.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (>= 2.15.2),svDialogs,KEGGREST |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | PAPi_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | PAPi_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | PAPi_1.0.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/PAPi/tree/release-2.12 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PAPi/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |