要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PAPi”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

爸爸

此包适用于Bioconductor 2.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见爸爸

根据代谢组学数据预测代谢通路活性

Bioconductor版本:2.12

途径活性谱(PAPi)是一个R包,用于预测代谢途径的活性,仅基于代谢组学数据集,其中包含已识别的代谢物列表及其在不同生物样品中的各自丰度。PAPi产生了改善最终生物学解释的假设。见阿乔,r.b.m.;Ruggiero, K.和Villas-Boas, S.G.(2010) -途径活性谱(PAPi):从代谢物谱到代谢途径活性。生物信息学。

作者:拉斐尔·阿乔

维护者:拉斐尔·阿乔<拉斐尔。Aggio在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“爸爸”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PAPi”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“爸爸”)

PDF R脚本 应用爸爸
PDF PAPi.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews MassSpectrometry代谢组学软件
版本 1.0.0
在Bioconductor BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (>= 2.15.2),svDialogsKEGGREST
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 PAPi_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 PAPi_1.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) PAPi_1.0.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/PAPi/tree/release-2.12
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PAPi/
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支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心